La Unidad Educativa Particular Emanuel abrió sus puertas al público el día 17 de agosto del 2000, llamándose Escuela Básica Particular Adventista Emanuel y este inicio fue posible por la gestión realizada del Pr. Jorge Burgos Cevallos. En ese entonces tan solo contábamos con primero hasta séptimo EGB y teníamos un total de 163 estudiantes matriculados.

 A partir del año lectivo 2002 – 2003 ya contábamos con octavo, noveno y décimo EGB en la jornada vespertina esto fue posible gracias a la gestión del Lic. Miguel Escalante, quién también fue nuestro primer rector y cofundador de esta unidad.

Para el año 2005 contábamos bachillerato con especialidades técnicas en informática y contabilidad, ya para el 2010 las especialidades técnicas fueron cambiadas por bachillerato general unificado en ciencias y continua hasta la actualidad.